Üniversitemiz Döner Sermaye İşletmesinin yönetim organı Üniversite Yönetim Kuruludur. Üniversite Yönetim Kurulu; 2022 yılında  yeni birim açılması veya birim kapanmasına ilişkin kararlar ile  Rektör, rektör yardımcıları ve genel sektere yapılacak yönetici payı ödemelerine ilişkin kararlar alma dışındaki yetkilerini  Döner Sermaye Yürütme Kuruluna devretmiştir. Döner Sermaye Yürütme Kurulu, Üniversite Yönetim Kurulunca seçilen bir rektör yardımcısı, üç öğretim elemanı ve döner sermaye işletme müdürü olmak üzere beş kişiden oluşmaktadır. Döner sermaye işletmemizin harcama yetkilisi bütçe ile ödenek tahsis edilen her bir birimin en üst yöneticisi veya anılan görevi yürütmekle görevlendirilen kişilerdir.